var oFile2 = [ //"файловая система", id - ID, in - в какой папке
    {
        name: "root",
        file: "folder",
        id: "97239",
        in: "0"
    }, {
        name: "Efog",
        file: "folder",
        id: "97280",
        in: "0"
    }, {
        name: "My Pics",
        file: "folder",
        id: "97250",
        in: "97239"
    }, {
        name: "CP.txt",
        file: "txt",
        id: "97242",
        in: "97239"
    }, {
        name: "SC.png",
        file: "png",
        id: "97240",
        in: "97239"
    }, {
        name: "GC.mp3",
        file: "mp3",
        id: "97243",
        in: "97239"
    }, {
        name: "5.avi",
        file: "avi",
        id: "97244",
        in: "97239"
    }, {
        name: "123.txt",
        file: "txt",
        id: "97242",
        in: "97250"
    }, {
        name: "456.txt",
        file: "txt",
        id: "97242",
        in: "97250"
    }
]

var testCopy = function() { //сюда пока можешь не смотреть, в copyFolder разберись
    $.each(oFile2, function (_i, _v) {
        console.log(_v.in);
    });
    var abc = copyFolder(97239, 97280).split(",");
    $.each(abc, function (i, v) {
        if (v > 0) {
            $.each(oFile2, function (_i, _v) {
                console.log(_v.in);
                if (_v.in == v) deleteFileById(_v.id);
            });
        }
    })
}

var copyFolder = function(what, to) {
    var _what = "";
    var todelete = what + ","; //сюда пока тоже не смотри
    var _to = "";
    $.each(oFile2, function (i, value) { //так надо, у меня ф-я принимает JQuery объект, тут 100% правльно
        if (value.id == what)
            _what = $('<div class="file" file="' + value.file + '" name="' + value.name + '" fid="' + value.id + '"></div>');
    });
    globalId++; //ну, последний ID, инкремент
    addFile(_what, globalId, to); //создаем папку в той, куда копируем
    var folderId = globalId; //а это - куда копировать остальное
    globalId++; 

    for (var i = 1; i < oFile2.length; i++) {
        var v = oFile2[i];
        if (v.in == what) { //если файл в той папке, из которой копируем...
            if (v.file == "folder") todelete += copyFolder(v.id, folderId) + ","; //если это папка, то здравствуй, рекурсия
            else {
            	//иначе - копируем файл
                file = $('<div class="file" file="' + v.file + '" name="' + v.name + '" fid="' + v.id + '"></div>');
                addFile(file, globalId, folderId);
                globalId++; //ну и инкремент
            }
        }
    }
    return todelete;
} //вроде должно пахать идеально, да?